MSD_Prostate
MSD前列腺数据集是医学分割十项挑战赛（Medical Segmentation Decathlon，MSD）中的Task05，旨在从多参数磁共振图像（T2、ADC）中分割前列腺的两个区域：中央腺体和外周带。MSD选择该数据集的原因是分离两个相邻区域具有挑战性，且这些区域在不同个体间表现出高度变异性。该数据集包含48例患者的T2加权和ADC磁共振图像，其中32例作为训练集，16例作为测试集。测试结果可提交至官网进行评估。
腹部可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
数据集元信息
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 前列腺 |
| 解剖区域 | 腹部 |
| 类别数 | 104 |
| 数据量 | 1204 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
Task05_Prostate
│
├── imagesTr
│ ├── prostate_00.nii.gz
│ └── ...
├── labelsTr
│ ├── prostate_00.nii.gz
│ └── ...
├── imagesTs
│ ├── prostate_03.nii.gz
│ └── ...
└── dataset.json图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.60, 0.60, 3.0) |
(256, 256, 11) |
| 中位值 | (0.63, 0.63, 3.6) |
(320, 320, 20) |
| 最大值 | (0.75, 0.75, 4.0) |
(384, 384, 24) |
引用
@article{antonelli2022medical,
title={The Medical Segmentation Decathlon},
author={Antonelli, Michela and Reinke, Annika and Bakas, Spyridon and others},
journal={Nature Communications},
year={2022},
doi={10.1038/s41467-022-30695-9}
}
@misc{simpson2019large,
title={A large annotated medical image dataset for the development and evaluation of segmentation algorithms},
author={Amber L. Simpson and Michela Antonelli and Spyridon Bakas and Michel Bilello and Keyvan Farahani and Bram van Ginneken and Annette Kopp-Schneider and Bennett A. Landman and Geert Litjens and Bjoern Menze and Olaf Ronneberger and Ronald M. Summers and Patrick Bilic and Patrick F. Christ and Richard K. G. Do and Marc Gollub and Jennifer Golia-Pernicka and Stephan H. Heckers and William R. Jarnagin and Maureen K. McHugo and Sandy Napel and Eugene Vorontsov and Lena Maier-Hein and M. Jorge Cardoso},
year={2019},
eprint={1902.09063},
archivePrefix={arXiv},
primaryClass={cs.CV}
}