MSD Spleen
MSD Spleen 数据集是 MSD (Medical Segmentation Decathlon, 医学图像分割十项全能挑战赛) 中的 Task09 即第 9 个子任务，目标是从 CT 图像中分割出脾脏，MSD 选择该数据集的原因是“前景的尺寸变化很大”。该数据集包含 61 例 3D 门脉期 CT 数据，数据都来自接受化疗治疗肝转移的患者，官方划分为 41 例训练集和 20 例测试集，其中测试集可以通过官网提交分割结果进行测试。 脾脏作为一个关键的淋巴器官，在血液过滤和免疫防御中起着至关重要的作用，它不仅清除血液中的废弃物和病原体，而且调节血细胞的储备与释放。脾脏疾病在CT图像上可能表现为脾脏体积的异常增大，或是脾脏内部密度的不均匀改变。当脾脏严重损伤、功能紊乱或对治疗不响应时，脾脏切除手术可能成为必要。尽管脾脏切除后人体能够存活，但这会降低其免疫防护能力，增加感染的风险。
腹部可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | ct |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | Spleen |
| 解剖区域 | abdomen |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 61 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
Task09_Spleen
│
├── imagesTr
│ ├── spleen_2.nii.gz
│ └── ...
├── labelsTr
│ ├── spleen_2.nii.gz
│ └── ...
├── imagesTs
│ ├── spleen_1.nii.nii.gz
│ └── ...
└── dataset.json图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.61, 0.61, 1.5) |
(512, 512, 31) |
| 中位值 | (0.79, 0.79, 5.0) |
(512, 512, 90) |
| 最大值 | (0.98, 0.98, 8.0) |
(512, 512, 168) |
引用
@article{antonelli2022medical,
title={The Medical Segmentation Decathlon},
author={Antonelli, Michela and Reinke, Annika and Bakas, Spyridon and others},
journal={Nature Communications},
year={2022},
doi={10.1038/s41467-022-30695-9}
}
@misc{simpson2019large,
title={A large annotated medical image dataset for the development and evaluation of segmentation algorithms},
author={Amber L. Simpson and Michela Antonelli and Spyridon Bakas and Michel Bilello and Keyvan Farahani and Bram van Ginneken and Annette Kopp-Schneider and Bennett A. Landman and Geert Litjens and Bjoern Menze and Olaf Ronneberger and Ronald M. Summers and Patrick Bilic and Patrick F. Christ and Richard K. G. Do and Marc Gollub and Jennifer Golia-Pernicka and Stephan H. Heckers and William R. Jarnagin and Maureen K. McHugo and Sandy Napel and Eugene Vorontsov and Lena Maier-Hein and M. Jorge Cardoso},
year={2019},
eprint={1902.09063},
archivePrefix={arXiv},
primaryClass={cs.CV}
}