QUBIQ2021
2021年生物医学图像量化不确定性挑战赛（QUBIQ2021）聚焦于生物医学成像中的不确定性量化，提供了包含2D和3D MRI与CT数据集的语义分割数据。这些数据集涵盖前列腺癌、脑部生长区域、脑肿瘤、肾脏、胰腺及胰腺病灶的分割任务。本文主要讨论挑战赛数据集中的3D数据，均为CT数据集，包括两部分分割内容：胰腺和胰腺病灶。
腹部可视化图片
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QUBIQ2021_0.png
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | ct |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 胰腺、胰腺病灶 |
| 解剖区域 | 腹部 |
| 类别数 | 2 |
| 数据量 | 90 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
Dataset
│
├── training_data_v3_QC
│ ├── pancreas
│ │ ├── case1-1
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
│ │ ├── case1-2
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
│ ├── pancreatic-lesion
│ │ ├── case1-1
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
│ │ ├── case1-2
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
├── validation_data_qubiq2021_QC
│ ├── pancreas
│ │ ├── case13-1
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
│ │ ├── case13-2
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
│ ├── pancreatic-lesion
│ │ ├── case13-1
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...
│ │ ├── case13-2
│ │ │ ├── image.nii.gz
│ │ │ ├── task01_seg01.nii.gz
│ │ │ ├── ...图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (1, 1, 1) |
(36, 512, 512) |
| 中位值 | (1, 1, 1) |
(53, 512, 512) |
| 最大值 | (1, 1, 1) |
(194, 512, 512) |
引用
@inproceedings{vzukovec2021modeling,
title={Modeling Multi-annotator Uncertainty as Multi-class Segmentation Problem},
author={{\v{Z}}ukovec, Martin and Dular, Lara and {\v{S}}piclin, {\v{Z}}iga},
booktitle={International MICCAI Brainlesion Workshop},
pages={112--123},
year={2021},
organization={Springer}
}