SPPIN
SPPIN（小儿神经母细胞瘤手术规划）是一个专为神经母细胞瘤手术规划设计的多模态MRI分割数据集。该数据集包含来自34名患者的79个带精确标注的训练扫描。此外还包括由3名患者的7个扫描组成的初步验证集，以及由11名患者的24个扫描组成的最终测试集。数据模态包括T2加权成像、对比增强T1加权成像和两个b值的扩散加权成像(DWI)，共四种模态。神经母细胞瘤是儿童常见癌症，占儿童癌症相关死亡的15%。这类肿瘤常位于腹部，可能靠近或包围重要器官和血管，因此准确高效的术前影像分割工具尤为重要。
腹部可视化图片
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数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 肿瘤 |
| 解剖区域 | 腹部 |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 80训练集，7验证集，24测试集 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
SPPIN_Dataset
├── SPPIN_train
│ ├── PT_06
│ │ ├── 20180628
│ │ │ ├── PT_06_DWI_b0_20180628.nii
│ │ │ ├── PT_06_DWI_b0_20180628.nii
│ │ │ ├── PT_06_NB_20180628.nii.gz
│ │ │ ├── PT_06_T1_gd_20180628.nii
│ │ │ └── PT_06_T2_20180628.nii
│ ├── . . .
│ └── PT_92
└── 20180628
├── PT_92_DWI_b0_20181026.nii
├── PT_92_DWI_b0_20181026.nii
├── PT_92_NB_20181026.nii.gz
├── PT_92_T1_gd_20181026.nii
└── PT_92_T2_20181026.nii图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.7440, 0.7440, 1.2978) |
(336, 336, 161) |
| 中位值 | (0.9115, 0.9115, 1.5096) |
(384, 384, 330) |
| 最大值 | (0.9115, 0.9115, 3.1040) |
(384, 384, 360) |
引用
@inproceedings{buser2023surgical,
author = {Myrthe A.D. Buser and Alida F.W. van der Steeg and Dominique C. Simons and Marc H.W.A. Wijnen and Annemieke S. Littooij and Annemiek H. ter Brugge and Iris N. Vos and Bas H.M. van der Velden},
title = {Surgical Planning in Pediatric Neuroblastoma},
booktitle = {International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI) 2023},
year = {2023},
publisher = {Zenodo},
url = {https://doi.org/10.5281/zenodo.7848306}
}