CTSpine1K
CTSpine1K 是一个专门用于脊柱分割的大规模 CT 数据集。该数据集汇集了来自四个公开数据集的总计 1005 例 CT 数据，并对其进行了 C1-C7、T1-T12 以及 L1-L6 共 25 类脊椎的标注。需要特别指出的是，大部分病人并没有 L6 脊椎，因此这类数据是较为罕见的。这四个公开数据集为：COLONOG, HNSCC-3DCT-RT, MSD Liver 和 COVID-19。CTSpine1K 并未采纳这些数据集的全部数据，而是经过筛选，剔除了其中质量较差的部分。为了实现合理的数据划分，CTSpine1K 保证四个数据集的数据在训练、验证和测试集中的比例是相同的。
骨头可视化图片
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可视化图片 2
可视化图片 3
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | ct |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | cervical vertebra, thoracic, lumbar spine |
| 解剖区域 | Vertebrae |
| 类别数 | 25 |
| 数据量 | 610 for training, 197 for validation, 198 for test |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
CTSpine1K
|-- Path.csv
|-- data_split.txt
|-- model_final_checkpoint.model
|-- model_final_checkpoint.model.pkl
|-- plans.pkl
|-- readme.txt
|-- data
| |-- COVID-19
| | |-- volume-covid19-A-0003_ct.nii.gz
| | |-- ...
| |-- HNSCC-3DCT-RT_neck
| | |-- HN_P001.nii.gz
| | |-- ...
| |-- colon
| | |-- 1.3.6.1.4.1.9328.50.4.0001.nii.gz
| | |-- ...
| |-- liver
| | |-- liver_0.nii.gz
| | |-- ...
| |-- metadata_colonog.xlsx
| |-- metadata_neck.xlsx
|-- label
| |-- COVID-19
| |-- HNSCC-3DCT-RT_neck
| |-- Liver
| |-- Verse
| |-- completed_annotation_verse
| |-- conlon图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.45, 0.45, 0.45) |
(512, 512, 42) |
| 中位值 | (0.76, 0.76, 0.80) |
(512, 512, 535) |
| 最大值 | (1.27, 1.27, 5.0) |
(512, 512, 1026) |
引用
@misc{deng2021ctspine1k,
title={CTSpine1K: A Large-Scale Dataset for Spinal Vertebrae Segmentation in Computed Tomography},
author={Yang Deng and Ce Wang and Yuan Hui and Qian Li and Jun Li and Shiwei Luo and Mengke Sun and Quan Quan and Shuxin Yang and You Hao and Pengbo Liu and Honghu Xiao and Chunpeng Zhao and Xinbao Wu and S. Kevin Zhou},
year={2021},
eprint={2105.14711},
archivePrefix={arXiv},
primaryClass={eess.IV}
}