Lumbosacral_Spine_MRI
脊髓损伤（Spinal cord injury, SCI）是一种严重创伤，会显著损害患者产生功能性站立和行走的能力。尽管过去几十年针对SCI的有效康复疗法非常有限，但最新研究表明神经调控技术有望帮助SCI患者重新站立行走。具体而言，负责产生站立和步态的关键神经集群通常位于损伤部位下方。因此，通过外部刺激激活损伤部位下方完好的脊髓节段，可以触发下肢肌肉运动。
骨头可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
可视化图片 3
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | detection |
| 解剖结构 | 脊髓 |
| 解剖区域 | 脊神经根 |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 14 |
| 文件格式 | .json, .nii.gz |
文件结构
具体文件结构看可视化图3
(a) 在根目录的/rawdata/sub-#/anat分支中提供了未经额外处理的匿名数据，包括CISS、DESS和T2-TSE序列成像数据。
(b) 处理后的衍生数据根据它们相关的流程在/derivatives分支中进行组织。提供了标记硬膜位置的点（/markers/sub-#/sub-#dura{i}.json，其中i指的是展示硬膜的CISS切片数），脊髓白质与脑脊液之间的边界（/markers/sub-#/sub-#cord{i}.json，i指的是展示白质的CISS切片数），神经节（/markers/sub-#/sub-#ganglions{segment}{side}.json，其中segment是目标节段（L1至S2），side表示左侧或右侧），以及神经根的轨迹（/markers/sub-#/sub-#nerveroots{segment}{side}.json）。
基于这些标注，生成了模型（/model）。
此外，还提供了使用MRIQC19生成的CISS、DESS和T2-TSE原始数据的详细图像质量报告（/anatqc）。图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.30, 0.30, 2.00) |
(240, 240) |
| 中位值 | (0.35, 0.35, 1.80) |
(243, 243) |
| 最大值 | (0.63, 0.63, 3.00) |
(288, 288) |
引用
@article{liu2024open,
title={An open-access lumbosacral spine MRI dataset with enhanced spinal nerve root structure resolution},
author={Liu, Jionghui and Zhang, Wenqi and Zhou, Yuxing and Xu, Linhao and Chu, Ying-Hua and Jia, Fumin},
journal={Scientific Data},
volume={11},
number={1},
pages={1131},
year={2024},
publisher={Nature Publishing Group UK London}
}