MRBrains13
MRBrains13是一个公开可用的脑部图像分割数据集。该数据集提供高质量3T-MR脑部图像，旨在对脑部MR图像中的解剖结构（如灰质、白质和脑脊液）进行分割。此外，数据集还提供多序列MR图像，包括完整标注的T1加权、T1加权反转恢复序列和FLAIR MR图像。每个序列包含20个病例。这些解剖结构的掩膜由专家标注，并由未参与初始标注过程的其他专家进行审核和校正。数据集包含5个训练病例和15个测试病例，测试集不提供标注结果。
toujingbu可视化图片
MRBrains13_0.png
MRBrains13_1.webp
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 灰质、白质、脑脊液 |
| 解剖区域 | 脑部 |
| 类别数 | 3 |
| 数据量 | 20 |
| 文件格式 | .nii |
文件结构
MRBrainS13DataNii
│
├── TestData
│ ├── 1
│ │ ├── T1_1mm.nii
│ │ ├── T1_IR.nii
│ │ ├── T1.nii
│ │ └── T2_FLAIR.nii
│ ├── 2
│ │ ├── T1_1mm.nii
│ │ ├── T1_IR.nii
│ │ ├── T1.nii
│ │ └── T2_FLAIR.nii
│ ├── 3
│ ├── T1_1mm.nii
│ ├── T1_IR.nii
│ ├── T1.nii
│ └── T2_FLAIR.nii
│ └── ...
│
├── TrainingData
│ ├── 1
│ │ ├── LabelsForTesting.nii
│ │ ├── LabelsForTraining.nii
│ │ ├── T1_1mm.nii
│ │ ├── T1_IR.nii
│ │ ├── T1.nii
│ │ └── T2_FLAIR.nii
│ ├── 2
│ │ ├── LabelsForTesting.nii
│ │ ├── LabelsForTraining.nii
│ │ ├── T1_1mm.nii
│ │ ├── T1_IR.nii
│ │ ├── T1.nii
│ │ └── T2_FLAIR.nii
│ ├── 3
│ ├── LabelsForTesting.nii
│ ├── LabelsForTraining.nii
│ ├── T1_1mm.nii
│ ├── T1_IR.nii
│ ├── T1.nii
│ └── T2_FLAIR.nii
│ └── ...
│
└── ...图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.95833,0.95833,3.00) |
(240,240,48) |
| 中位值 | (0.95833,0.95833,3.00) |
(240,240,48) |
| 最大值 | (0.95833,0.95833,3.00) |
(240,240,48) |
引用
@article{mendrik2015mrbrains,
title={MRBrainS challenge: online evaluation framework for brain image segmentation in 3T MRI scans},
author={Mendrik, Adriënne M and Vincken, Koen L and Kuijf, Hugo J and Breeuwer, Marcel and Bouvy, Willem H and De Bresser, Jeroen and Alansary, Amir and De Bruijne, Marleen and Carass, Aaron and El-Baz, Ayman and others},
journal={Computational intelligence and neuroscience},
volume={2015},
number={1},
pages={813696},
year={2015},
publisher={Wiley Online Library}
}