SPIDER
SPIDER（脊柱分割：椎间盘、椎体及椎管）数据集是一个大规模多中心的脊柱MRI数据集，提供脊柱、椎间盘（intervertebral discs，IVDs）和椎管的分割标注。该数据集公开提供了218名腰痛患者的447幅矢状位T1和T2 MRI序列图像，其中少数患者还包含T2 Space序列图像。数据来自4家不同医院，其中179名患者的图像作为训练集，39名患者的图像作为验证集。另有39名未公开患者的97幅图像用于竞赛评估。数据集同时提供了患者性别信息和部分患者年龄数据。每幅MRI图像均列出了扫描设备和采集参数。每幅图像还提供了多种退行性改变的放射学分级，包括Modic改变（分为I、II、III型）、终板改变或Schmorl结节、脊椎滑脱、椎间盘突出、椎间隙狭窄、椎间盘膨出以及Pfirrmann分级（1-5级）。所有这些放射学分级都针对每个椎间盘节段进行了详细标注。
骨头可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
可视化图片 3
可视化图片 4
可视化图片 5
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 脊柱、椎间盘、椎管 |
| 解剖区域 | 脊椎 |
| 类别数 | 19 |
| 数据量 | 554 |
| 文件格式 | .mha |
文件结构
SPIDER
│
├── images
│ ├── 1_t1.mha
│ ├── 1_t2.mha
│ ├── 2_t1.mha
│ ├── 2_t2.mha
│ └── ...
│
├── masks
│ ├── 1_t1.mha
│ ├── 1_t2.mha
│ ├── 2_t1.mha
│ ├── 2_t2.mha
│ └── ...
│
├── overview.csv
│
└── radiological_gradings.csv 图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.47, 0.25, 0.08) |
(17, 264, 8) |
| 中位值 | (3.3, 0.63, 0.66) |
(424, 448, 25) |
| 最大值 | (9.6, 1.1, 3.3) |
(3682, 1168, 512) |
引用
@misc{vandergraaf2023lumbar,
title={Lumbar spine segmentation in MR images: a dataset and a public benchmark},
author={Jasper W. van der Graaf and Miranda L. van Hooff and Constantinus F. M. Buckens and Matthieu Rutten and Job L. C. van Susante and Robert Jan Kroeze and Marinus de Kleuver and Bram van Ginneken and Nikolas Lessmann},
year={2023},
eprint={2306.12217},
archivePrefix={arXiv},
primaryClass={eess.IV}
}