IvyGAP-Radiomics
IvyGAP-Radiomics 数据集是一个MR模态中分割胶质母细胞瘤的数据集。是TCIA的一个数据集。这个数据集包含了来自 Ivy Glioblastoma Atlas Project（Ivy GAP）的术前多机构扫描的肿瘤子区段的两个配对专家分割标签集。这些标签由宾夕法尼亚大学医院和凯斯西储大学的独立专家认证的神经放射科医生标注，并提供了MRI的T1,T2,T1-Gd,Flair这四种模态，所有影像数据均以NIfTI格式提供。 该数据集的目的是为定量计算和临床研究提供无需重复手动注释的专家分割标签，同时允许跨研究比较。它还可以作为计算竞赛（例如国际脑肿瘤分割挑战赛）的手动注释金标准标签。提供的稳健放射组学特征面板可以促进研究人员在没有足够计算背景的情况下进行分子标记、临床结果、治疗反应等方面的关联研究。
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数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | Brain |
| 解剖区域 | Head and Neck |
| 类别数 | 3 |
| 数据量 | 31 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
.
├── metadata.csv
├── Multi-institutional\ Paired\ Expert\ Segmentations\ MNI\ images-atlas-annotations
│ ├── 1_Images_MNI
│ │ └── CoRegistered_SkullStripped
│ │ ├── W1
│ │ │ ├── W1_1996.10.25_bias_ss_FLAIR.nii.gz
│ │ │ ├── W1_1996.10.25_bias_ss_T1.nii.gz
│ │ │ └── W1_1996.10.25_bias_ss_T2.nii.gz
│ │ ├── W10
│ │ │ ├── W10_1997.04.29_bias_ss_FLAIR.nii.gz
│ │ │ ├── W10_1997.04.29_bias_ss_T1.nii.gz
│ │ │ └── W10_1997.04.29_bias_ss_T2.nii.gz
│ │ ├── W11
│ │ │ ├── ...
│ ├── 2_Atlas_MNI
│ │ └── mni_icbm152_t1_tal_nlin_asym_09c.nii.gz
│ └── 3_Annotations_MNI
│ └── CWRU
│ ├── W1
│ │ └── W1_1996.10.25_CWRU_labels.nii.gz
│ ├── W10
│ │ └── W10_1997.04.29_CWRU_labels.nii.gz
│ ├── W11
│ │ └── ...
├── Multi-Institutional\ Paired\ Expert\ Segmentations\ Radiomic\ Features\ and\ Reproducibility\ Evaluation\ on\ SRI.zip
└── Multi-Institutional\ Pai图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (1.0, 1.0, 1.0) |
(240, 240, 155) |
| 中位值 | (1.0, 1.0, 1.0) |
(240, 240, 155) |
| 最大值 | (1.0, 1.0, 1.0) |
(240, 240, 155) |
引用
@article{pati2020reproducibility,
title={Reproducibility analysis of multi-institutional paired expert annotations and radiomic features of the Ivy Glioblastoma Atlas Project (Ivy GAP) dataset},
author={Pati, Sarthak and Verma, Ruchika and Akbari, Hamed and Bilello, Michel and Hill, Virginia B and Sako, Chiharu and Correa, Ramon and Beig, Niha and Venet, Ludovic and Thakur, Siddhesh and others},
journal={Medical physics},
volume={47},
number={12},
pages={6039--6052},
year={2020},
publisher={Wiley Online Library}
}