TotalSegmentator
TotalSegmentator是目前公开可用的最大规模三维医学图像分割数据集，包含1204例CT扫描图像，涵盖104种解剖结构。其中1082例用于训练，57例用于验证，65例用于测试。与大多数仅关注部分器官且数据量有限的数据集不同，TotalSegmentator提供了前所未有的数据规模和多样性，能更好地适应多变的临床场景。此外，该数据集标注了一些在其他数据集中罕见的结构，为模型研究和优化提供了坚实基础。
全身可视化图片
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数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | ct |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 27个器官；59块骨骼；10块肌肉；8条血管 |
| 解剖区域 | 全身 |
| 类别数 | 104 |
| 数据量 | 1204 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
TotalSegmentator
│
├── meta.csv
│
├── s0000
│ ├── segmentations
│ │ ├── adrenal_gland_left.nii.gz
│ │ ├── adrenal_gland_right.nii.gz
│ │ ├── aorta.nii.gz
│ │ └── ...
│ ├── ct.nii.gz
│
├── s0001
├── s0002
├── s0003
└── ...图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (1.5, 1.5, 1.5) |
(47, 48, 29) |
| 中位值 | (1.5, 1.5, 1.5) |
(241, 231, 231) |
| 最大值 | (1.5, 1.5, 1.5) |
(499, 430, 851) |
引用
@article{totalsegmentator,
author = {Wasserthal, Jakob and Breit, Hanns-Christian and Meyer, Manfred T. and Pradella, Maurice and Hinck, Daniel and Sauter, Alexander W. and Heye, Tobias and Boll, Daniel T. and Cyriac, Joshy and Yang, Shan and Bach, Michael and Segeroth, Martin},
title = {TotalSegmentator: Robust Segmentation of 104 Anatomic Structures in CT Images},
journal = {Radiology: Artificial Intelligence},
volume = {5},
number = {5},
pages = {e230024},
year = {2023}
}