ATLAS
ATLAS (A Tumour and Liver Automatic Segmentation) 是今年 MICCAI 2023 Challenge 中新 release 的数据集之一，如全称所示，是一个 肝脏及肿瘤 的分割数据集，有些类似于以前介绍的 LiTS 数据集。与之不同的是，ATLAS 数据集提供的是 90 例 CE-MRI (Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Imaging) 模态的数据集，而不是 LiTS 的 CT 模态数据。这种模态差异是由于 ATLAS 数据集的收集和肝细胞癌的经动脉放射性栓塞 (transarterial radioembolisation, TARE) 治疗相关，而 TARE 治疗需要术前拍摄 CE-MRI 图像来进行放射计量估算；而传统的外科治疗方法相关的肝脏手术则以 CT 图像为主，只要能明确肿瘤的定位即可。总而言之，独特的 CE-MRI 模态丰富了腹部分割 Benchmark 的模态，可喜可贺。
toujingbu可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | liver, hepatocellular carcinoma |
| 解剖区域 | abdomen |
| 类别数 | 2 |
| 数据量 | 60 for training, 30 for test. |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
Dataset
│
├── imagesTr
│ ├── im01.nii.gz
│ └── ...
├── labelsTr
│ ├── im01.nii.gz
│ └── ...
├── imagesTs
│ ├── im61.nii.gz
│ └── ...图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.68, 0.68, 2.00) |
(320, 250, 44) |
| 中位值 | (1.04, 1.04, 3.00) |
(384, 300, 80) |
| 最大值 | (1.41, 1.41, 4.00) |
(512, 512, 136) |
引用
@article{quinton2023tumour,
title={A Tumour and Liver Automatic Segmentation (ATLAS) Dataset on Contrast-Enhanced Magnetic Resonance Imaging for Hepatocellular Carcinoma},
author={Quinton, F{\'e}lix and Popoff, Romain and Presles, Beno{\^\i}t and Leclerc, Sarah and Meriaudeau, Fabrice and Nodari, Guillaume and Lopez, Olivier and Pellegrinelli, Julie and Chevallier, Olivier and Ginhac, Dominique and others},
journal={Data},
volume={8},
number={5},
pages={79},
year={2023},
publisher={MDPI}
}