CORN
CORN (CORneal Nerve Database) 是一个角膜神经数据集，由三个子集组成（CORN-1、CORN-2 和 CORN-3），这些子集分别用于角膜神经分割、图像增强和神经曲折度分级。本文先介绍 CORN-1 分割数据集。CORN-1 包含总共 1698 张使用 Heidelberg Retina Tomograph 配备的 Rostock Cornea Module (HRT-III) 显微镜拍摄的角膜基底上皮细胞的 CCM 图像。这些图像由中国北京大学第三医院和意大利帕多瓦大学采集。每张图像的分辨率为 384 × 384 像素，覆盖了 400 × 400 微米平方的视场（FOV）。这两个数据集中神经纤维（中心线）的手动标注是由一名眼科医生使用开源软件 ImageJ 完成的。 CCM（Corneal Confocal Microscopy，角膜共聚焦显微镜）是一种高级显微技术，用于清晰展示角膜细胞、神经和微观结构。角膜神经的变化常常预示着多种疾病的早期迹象，例如糖尿病性神经病变、干眼症、角膜感染以及其它神经退行性疾病。准确分割 CCM 图像中的角膜神经不仅对于诊断具有重要意义，还对于治疗效果的评估至关重要。这项技术使医生能够在疾病的不同阶段——包括治疗前和治疗后——详细监测角膜神经的变化。
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CORN_2.webp
数据集元信息
| 维度 | 2D |
| 模态 | other |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | Corneal Nerve |
| 解剖区域 | Eye |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 1698 |
| 文件格式 | .tif |
文件结构
CORN
├── Nerve_Segmentation
│ ├── Corneal nerve segmentation
│ │ ├── test
│ │ │ ├── test_images
│ │ │ └── test_mask
│ │ ├── training
│ │ │ ├── train_images
│ │ │ └── train_mask
│ │ └── val
│ │ ├── val_images
│ │ └── val_mask
│ └── Padova
│ ├── BioImLab corneal nerve images
│ ├── BioImLab corneal nerve images Ann
│ ├── BioImLab Corneal Nerve Tortuosity
│ └── BioImLab Corneal Nerve Tortuosity Ann图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | - |
384×384 |
| 中位值 | - |
384×384 |
| 最大值 | - |
384×384 |
引用
@inproceedings{mou2019cs,
title={CS-Net: channel and spatial attention network for curvilinear structure segmentation},
author={Mou, Lei and Zhao, Yitian and Chen, Li and Cheng, Jun and Gu, Zaiwang and Hao, Huaying and Qi, Hong and Zheng, Yalin and Frangi, Alejandro and Liu, Jiang},
booktitle={International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention},
pages={721--730},
year={2019},
organization={Springer}
}