CT-RATE
CT-RATE是一个包含配对胸部CT图像与相应放射诊断报告的大规模数据集，同时标注了报告中可能提及的18种异常情况。该数据集共计50,188例病例，其中训练集47,149例，验证集3,039例。CT-RATE涵盖了2015年5月至2023年1月期间采集的21,304名不同患者的平扫CT图像。对应的放射学报告包含四个部分：临床信息、成像技术、影像学表现和印象。临床信息包括患者症状和治疗史；成像技术涵盖成像协议、成像视角和造影剂使用情况；影像学表现包含解剖学和病理学观察结果，印象则是医生根据这些观察给出的结论。
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CT-RATE_0.png
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数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | other |
| 任务类型 | other |
| 解剖结构 | 胸部器官 |
| 解剖区域 | 胸部 |
| 类别数 | 18 |
| 数据量 | 50,188 |
| 文件格式 | .nii.gz, .csv |
文件结构
Dataset
│
├──── metadata/
│ ├── Metadata_Attributes.xlsx
│ ├── train_metadata.csv
│ └── validation_metadata.csv
├──── multi_abnormality_labels/
│ ├── train_predicted_labels.csv
│ └── valid_predicted_labels.csv
├──── radiology_text_reports/
│ ├── train_reports.csv
│ └── validation_reports.csv
├──── train/
│ ├── train_1/
│ │ ├── train_1_a/
│ │ ├── train_1_a_1.nii.gz
│ │ └── train_1_a_2.nii.gz
│ ├── ...
├──── valid/
│ ├── valid_1/
│ │ ├── valid_1_a/
│ │ ├── valid_1_a_1.nii.gz
│ │ └── valid_1_a_2.nii.gz
│ ├── ...图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | - |
- |
| 中位值 | - |
- |
| 最大值 | - |
- |
引用
@ARTICLE{2024arXiv240317834E,
author = {{Ethem Hamamci}, Ibrahim and {Er}, Sezgin and {Almas}, Furkan and {Gulnihan Simsek}, Ayse and {Nil Esirgun}, Sevval and {Dogan}, Irem and {Furkan Dasdelen}, Muhammed and {Wittmann}, Bastian and {Simsar}, Enis and {Simsar}, Mehmet and {Bensu Erdemir}, Emine and {Alanbay}, Abdullah and {Sekuboyina}, Anjany and {Lafci}, Berkan and {Ozdemir}, Mehmet K. and {Menze}, Bjoern},
title = {A foundation model utilizing chest CT volumes and radiology reports for supervised-level zero-shot detection of abnormalities},
journal = {arXiv preprint arxiv:2403.17834},
year = 2024,
}