DigestPath2019
DigestPath 2019（消化系统病理检测与分割挑战赛）是首个专注于消化系统结肠镜图像中印戒细胞（signet ring cells）检测与组织筛查的数据集，提供带有专家级标注的公开病理图像。该数据集包含阳性样本和阴性样本：阳性样本涉及20张全切片图像（WSIs，Whole Slide Images），其中印戒细胞均以XML格式标注了边界框；阴性样本来自79张WSIs，这些图像可能包含除印戒细胞外的其他肿瘤细胞。所有印戒细胞均由病理学家精确标记并附带矩形边界框。图像来源于两个器官——胃黏膜和肠道。
xianweichengxiang可视化图片
DigestPath2019_0.png
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DigestPath2019_2.webp
数据集元信息
| 维度 | 2D |
| 模态 | pathology |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 细胞 |
| 解剖区域 | 消化系统 |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 250 |
| 文件格式 | PNG |
文件结构
MoNuSeg
├── images
│ ├── 01.png
│ ├── 02.png
│ └── ...
├── masks
│ ├── 01.png
│ ├── 02.png
│ └── ...图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | - |
(2516, 4297) |
| 中位值 | - |
(4637, 4456) |
| 最大值 | - |
(22701, 19314) |
引用
@article{da2022digestpath,
title={DigestPath: A benchmark dataset with challenge review for the pathological detection and segmentation of digestive-system},
author={Da, Qian and Huang, Xiaodi and Li, Zhongyu and Zuo, Yanfei and Zhang, Chenbin and Liu, Jingxin and Chen, Wen and Li, Jiahui and Xu, Dou and Hu, Zhiqiang and others},
journal={Medical Image Analysis},
volume={80},
pages={102485},
year={2022},
publisher={Elsevier}
}