AbdomenAtlas 1.0 Mini 腹部多器官分割
AbdomenAtlas 1.0 Mini 是 AbdomenAtlas-8K 数据集目前公开的一个子集，包括5195个详细标注的CT体数据。而AbdomenAtlas-8K 数据集本身则更为庞大，总共包含8448例CT数据。AbdomenAtlas Mini 涉及脾脏（spleen）、肝脏（liver）、左肾脏（left kidney）、右肾脏（right kidney）、胃（stomach）、胆囊（gallbladder）、胰腺（pancreas）、主动脉（aorta）和下腔静脉（IVC）这9个类别（8类不同的器官，但在标注中肾脏的左右被标注为不同的器官）。另外需注意的是AbdomenAtlas Mini的原始图像数据来源于下图的16个公开数据集，其中大部分我们都在之前知乎文章中已经详细介绍过了，可参考文末数据集介绍文章总表。
腹部可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | ct |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 脾，肝，左右肾，胃，胆，胰，主动脉，下腔静脉 |
| 解剖区域 | 腹部 |
| 类别数 | 9 |
| 数据量 | 5195 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
AbdomenAtlas1.0Mini
├── BDMAP_00000001
│ ├── ct.nii.gz
│ └── segmentations
│ ├── aorta.nii.gz
│ ├── gall_bladder.nii.gz
│ ├── kidney_left.nii.gz
│ ├── kidney_right.nii.gz
│ ├── liver.nii.gz
│ ├── pancreas.nii.gz
│ ├── postcava.nii.gz
│ ├── spleen.nii.gz
│ └── stomach.nii.gz
├── BDMAP_00000002
├── BDMAP_00000003
├── ...
└── BDMAP_00005195图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.44, 0.39, 0.36) |
(29, 79, 49) |
| 中位值 | (0.83, 0.81, 2.0) |
(493, 364, 205) |
| 最大值 | (5.0, 3.0, 8.0) |
(1059, 519, 2572) |
引用
@article{qu2023abdomenatlas,
title={Abdomenatlas-8k: Annotating 8,000 CT volumes for multi-organ segmentation in three weeks},
author={Qu, Chongyu and Zhang, Tiezheng and Qiao, Hualin and Tang, Yucheng and Yuille, Alan L and Zhou, Zongwei and others},
journal={Advances in Neural Information Processing Systems},
volume={36},
year={2023}
}
@inproceedings{li2024well,
title={How Well Do Supervised Models Transfer to 3D Image Segmentation?},
author={Li, Wenxuan and Yuille, Alan and Zhou, Zongwei},
booktitle={The Twelfth International Conference on Learning Representations},
year={2024}
}