NeurIPS 2022 Cell Seg
NeurIPS 2022细胞分割竞赛（正式名称为"多模态高分辨率显微图像中的弱监督细胞分割"）推出了一个大规模、多模态的显微图像数据集用于细胞分割。该数据集汇集了来自全球十余个实验室、超过40项不同生物实验的图像，是迄今为止最多样化的细胞图像集合之一。它涵盖四种主要显微技术：微分干涉相差（Differential Interference Contrast, DIC）、荧光（Fluorescent）、相差（Phase-contrast）和明场（Brightfield），包含多种细胞类型如组织细胞、培养细胞、未标记细胞和染色细胞。训练集包含1000张标注图像和1500张未标注图像。验证集由100张公开标注的图像组成。测试集包含422张图像，其中包括两张荧光全切片图像（Whole Slide Images, WSIs），为研究者们增添了挑战。
xianweichengxiang可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
可视化图片 3
可视化图片 4
数据集元信息
| 维度 | 2D |
| 模态 | microscopy |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 细胞 |
| 解剖区域 | 细胞 |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 3022张图像 |
| 文件格式 | .png .bmp .tif .tiff |
文件结构
NeurIPS22-CellSeg
│
├── Testing
│ ├── Hidden
│ └── Public
│
├── Training
│ ├── images
│ ├── labels
│ └── unlabeled
│ └── ReadMe.md
│
└── Tuning
├── images
└── labels图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | - |
(200, 200) |
| 中位值 | - |
(970, 970) |
| 最大值 | - |
(4096, 4096) |
引用
@article{NeurIPS22CellSeg,
Author = {Jun Ma and Ronald Xie and Shamini Ayyadhury and Cheng Ge and Anubha Gupta and Ritu Gupta and Song Gu and Yao Zhang and Gihun Lee and Joonkee Kim and Wei Lou and Haofeng Li and Eric Upschulte and Timo Dickscheid and José Guilherme de Almeida and Yixin Wang and Lin Han and Xin Yang and Marco Labagnara and Sahand Jamal Rahi and Carly Kempster and Alice Pollitt and Leon Espinosa and Tâm Mignot and Jan Moritz Middeke and Jan-Niklas Eckardt and Wangkai Li and Zhaoyang Li and Xiaochen Cai and Bizhe Bai and Noah F. Greenwald and David Van Valen and Erin Weisbart and Beth A. Cimini and Zhuoshi Li and Chao Zuo and Oscar Brück and Gary D. Bader and Bo Wang},
Title = {The Multi-modality Cell Segmentation Challenge: Towards Universal Solutions},
Year = {2023},
Journal = {arXiv:2308.05864},
}