C3VD
C3VD（Colonoscopy3DVideoDataset）数据集由约翰霍普金斯大学开发，包含使用高清临床结肠镜和高保真结肠模型获取的结肠镜检查三维视频数据。该数据集作为结肠镜检查的测试基准，包含10,015张标注图像、22个配准视频以及配套的真实深度图、表面法线、光流、遮挡信息、六自由度位姿、覆盖图和三维模型。在本研究中，作者首先使用GAN生成结肠镜视频的深度图，然后联合优化相机位姿、深度图和模型渲染结果，最终获得高保真度的深度图、法线、光流等数据，使其成为目前信息量最丰富的内窥镜数据集。
内窥镜可视化图片
C3VD_1.webp
C3VD_0.png
数据集元信息
| 维度 | 2D |
| 模态 | endoscopy |
| 任务类型 | registration |
| 解剖结构 | 结肠 |
| 解剖区域 | 结肠 |
| 类别数 | 22 |
| 数据量 | 10015 |
| 文件格式 | png, tiff, txt |
文件结构
C3VD
└── SAMPLE_DIR/ # working directory for the given video sequences
├── config.ini # parameter file
├── model.obj # ground truth 3D model
├── model.mtl # ground truth 3D model material
├── pose.txt # robot pose log; one pose per line, formatted <time in seconds> <homogenous pose in column-major form>
├── mask.png # binary corner mask for Olympus endoscopes
├── rgb/ # rgb image folder
│ ├── 0000.png
│ ├── 0001.png
│ │ ...
│ └── N-1.png
├── depth/ # GAN-predicted depth image folder
│ ├── 0000.png
│ ├── 0001.png
│ │ ...
│ └── N-1.png
├── results/ # registration results folder
└── render/ # gt rendering output folder图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | - |
1350 * 1080 |
| 中位值 | - |
1350 * 1080 |
| 最大值 | - |
1350 * 1080 |
引用
@article{bobrow2023,
title={Colonoscopy 3D video dataset with paired depth from 2D-3D registration},
author={Bobrow, Taylor L and Golhar, Mayank and Vijayan, Rohan and Akshintala, Venkata S and Garcia, Juan R and Durr, Nicholas J},
journal={Medical Image Analysis},
pages={102956},
year={2023},
publisher={Elsevier},
}