PanSegData 大规模 MRI 胰腺分割
PanSegData是迄今为止最大的 MRI 胰腺分割数据集，包含来自五个中心的大量T1和T2加权腹部MRI扫描图像，时间跨度从2004年3月至2022年11月，共767次扫描，涉及499名参与者。其中，T1加权扫描图像有385张，T2加权扫描图像有382张。该数据集提供了丰富的胰腺MRI图像资源，涵盖了不同设备、扫描协议和患者群体，为研究人员提供了一个全面的、多样化的数据集，用于开发和验证胰腺分割算法。
腹部可视化图片
可视化图片 1
可视化图片 2
数据集元信息
| 维度 | 3D |
| 模态 | mri |
| 任务类型 | segmentation |
| 解剖结构 | 胰腺 |
| 解剖区域 | 腹部 |
| 类别数 | 1 |
| 数据量 | 767 |
| 文件格式 | .nii.gz |
文件结构
PanSegData 数据集文件结构如下，t1 序列和 t2 序列的图像在两个单独的文件夹中存放。
PanSegData/
├── Pancreas_MRI_Dataset/
│ ├── t1/
│ │ ├── imagesTr/
│ │ │ ├── AHN_0005_0000.nii.gz
│ │ │ ├── AHN_0006_0000.nii.gz
│ │ │ └── ...
│ │ └── labelsTr/
│ │ ├── AHN_0001.nii.gz
│ │ ├── AHN_0002.nii.gz
│ │ └── ...
│ └── t2/
│ ├── imagesTr/
│ │ ├── AHN_0001_0000.nii.gz
│ │ ├── AHN_0002_0000.nii.gz
│ │ └── ...
│ └── labelsTr/
│ ├── AHN_0001.nii.gz
│ ├── AHN_0002.nii.gz
│ └── ...
└── Meta informations/
├── T1-name_mapping.json
├── T2-name_mapping.json
└── t2_info_osf.xlsx图像尺寸统计
| 统计类型 | 间距 (mm) | 尺寸 |
|---|---|---|
| 最小值 | (0.53, 0.53, 1.8) |
(256, 192, 20) |
| 中位值 | (1.09, 1.09, 4.4) |
(256, 256, 39) |
| 最大值 | (1.80, 1.80, 10.4) |
(604, 604, 148) |
引用
@article{zhang2024large,
title={Large-Scale Multi-Center CT and MRI Segmentation of Pancreas with Deep Learning},
author={Zhang, Zheyuan and Keles, Elif and Durak, Gorkem and Taktak, Yavuz and Susladkar, Onkar and Gorade, Vandan and Jha, Debesh and Ormeci, Asli C and Medetalibeyoglu, Alpay and Yao, Lanhong and others},
journal={arXiv preprint arXiv:2405.12367},
year={2024}
}